銀髮的阿基多于2006年上映。銀髮的阿基多也被叫做銀髮阿基德, Agito。

在人類修改植物遺傳因子，企圖控制植物的愚蠢計劃失敗后，樹木開始具有了思想意識，月球表面的樹木毫無節制的變大，並以無法想象的速度滋生蔓延，最終竟然化為龍型怪物襲擊了地球，爆炸帶來的強烈閃光籠罩著地球，地球面臨著從未有過的大災難。300年的時光匆匆流去……

　　地球在遭到有意識的樹木襲擊后，殘存下來的一部分人類為了求得生存放棄了與森林敵對的思想，開始尋求與森林共同生存之道。因此殘存下來的人分成了與森林共存的種族和與森林敵對的種族。阿基德(勝地涼配音)等人在叫做「中立都市」這個荒涼的地方以與森林共存為宗旨生活著，雖然環境極度惡劣但是他們仍然堅強愉快地過活。直到有一天，阿基德與好友凱因一起到傳說中的禁忌之泉取水，在那裡，阿基德發現了一個閃耀著神奇光芒的機械，以及沉睡在其中的美麗少女——朵拉(宮崎葵配音)，無意間的邂逅改變了那個世界的命運。阿基德喚醒了沉睡的朵拉，才知道原來她並不屬於這個時代，而是利用先進科技手段減緩新陳代謝，沉睡了300年的過去世界的人。

　　來到了「中立都市」的朵拉受到了現實世界的強烈衝擊——人們住在倒塌的建築中，即沒有電也沒有自來水，就連取泉水也困難重重……這樣的生活，讓這個來自文明社會的朵拉困惑了——難道世界變化了300年，科技文明反倒倒退的蕩然無存。「中立都市」的人們對待這位來自300年前的朵拉非常友善，可是森林卻像怪獸一樣對她展開莫名的攻擊，在無法忍受的情況下，朵拉的感情終於爆發了。

　　就在此時，與森林敵對的都市「萊克納」出現了一個同樣是來自過去的男人休納克。他告訴朵拉，她就是讓文明社會複原的關鍵，並要帶她離開。雖然朵拉可以讓人類擺脫現在的困境，但這個使命充滿著危險。為了保護朵拉，阿基德與「森林」簽定契約，得到了無窮大的力量，作為契約條件之一他變成了「銀髮」，伴隨著兩個人的「使命」和「禁斷之力」，充滿謎團的故事會怎樣發展呢？

出演銀髮的阿基多的明星有勝地涼, 古手川祐子, 大杉漣, 宮崎葵, 濱口優, 遠藤憲一。