特工小子3于2003年上映。特工小子3也被叫做非常小特務III遊戲結束, 特工小子III。

生活在網路里的是《黑客帝國2》，戰鬥在遊戲里的是《特工小子》。科學狂人和荒島驚魂后，這回天才特工小姐弟必須面對的，是解救全世界孩子的任務和一個龐大危險瘋狂的虛擬遊戲……
　　在莫名其妙的失去了他的特工工作以後，「少年版007」朱尼·柯蒂斯(達利奧·薩巴拉飾)被告知他必須設法進入一個虛擬遊戲的世界，他的姐姐卡門·柯蒂斯(阿歷克夏·維加飾)的精神被禁錮在那裡。
　　遊戲的設計者是一個被成為「玩具製造商」(席維斯·史泰龍飾)的狂人，他有五個全然不同的分裂人格，出於邪惡的目的，他希望能夠通過這個遊戲控制全世界的孩子。為了打敗他，朱尼加入了一個由全世界招募而來的孩子們組成的遊戲測試小組中，進入虛擬世界接受層出不窮的挑戰。朱尼面臨著一系列考驗：比如在熾熱的火山岩漿上衝浪，和巨大的機器人與異種怪獸交戰，又或者危險重重的奪命狂奔。
　　即使有曾經也是天才特工的祖父幫忙，朱尼能夠成功的通過這些關卡，拯救姐姐卡門並最終打敗邪惡的玩具製造商嗎？答案當然是……

出演特工小子3的明星有安東尼奧·班德拉斯, 達利奧·薩巴拉, 里卡多·蒙特爾班。