星際之門：亞特蘭帝斯第1季(2004)的海報和劇照

星際之門：亞特蘭帝斯第1季于2004年上映。星際之門：亞特蘭帝斯第1季也被叫做星際之門：亞特蘭帝斯第一季, 星際之門：亞特蘭帝斯, Stargate: Atlantis Season 1。

在Stargate SG-1第一季度里，SG-1無意中發現了在南極洲也有一個Stargate和一些遺迹以及有關Atlantis的資料。在第六季度，他們在那裡發現一位冰封住了的Ancient。經過常年的研究，Daneil終於發現了Atlantis其實是存在於另一個星系Pegasus(天馬座)，並且座標是使用8個符號而不是一般的7個符號。為了尋找Ancient的科技，Weir博士帶領了Atlantis小隊前往Atlantis。他們只能做單程旅行，直到他們能在那邊找到足夠的能源開啟Stargate連接地球。在Pegasus，他們找到了飛行城，當地原住民(也是Ancient帶來到這個星系的)以及一種以人類生命能量為食物的怪物Wraith。

1.01 "Rising, Part 1" 遠征（上）
通過在南極發現的古人前哨站的啟示，一個新的星門探測隊在Weir博士的帶領下開始執行前往另一個遙遠的星系的任務，在那裡他們發現了傳說中的城市——亞特蘭帝斯（Altantis）。

1.02 "Rising, Part 2" 遠征（下）
考察隊開始全面勘測Atlantis城市，獲得了一系列成果，這個在海底沉睡了一萬年的城市浮出水面，從見天日。

1.03 "Hide and Seek" 抓迷藏
在Atlantis基地發現了一個奇異的能態外星生命，導致了基地能源盡失。McKay利用他發現的個人保護裝置將其引出了星門。

1.04 "Thirty eight Minutes" 三十八分鐘
在一次任務中一架跳躍者探測船被困於星門中間，而Sheppard少校正為外星昆蟲侵害中。在星門關閉前他們只有38分鐘來解決問題。

1.05 "Suspicion" 猜疑
在一連串任務中均被Wraith伏擊后，他們懷疑在Athosian人中有間諜，從而開始了清察行動。

1.06 "Childhood's End" 告別童年
Sheppard和小隊在一個行星發現這裏的人都活不過24歲，因為有種自殺儀式使他們相信這樣可以避免Wraith的傷害。

1.07 "Poisoning the Well" 毒陣
小隊發現一個星球上的人們正致力於開發一種藥劑，能使他們自己避免成為Warith的食物。但這種東西並非十全十美的，它具有毒性。

1.08 "Underground" 秘密
Atlantis開始和一個叫Genii的種族開展貿易活動，但小隊發現這個新聯盟有著隱蔽的動機。

1.09 "Home" 歸家
Mckay他們發現一個大氣里充滿能量的星球，然後他們利用這些能量啟動星門回了地球，但這一切似乎不是真實的。

1.10 "The Srorm" 暴風雨
一個強烈的暴風雨即將襲擊Atlantis，他們決定暫時撤到另一個行星躲避。這時他們的新敵人Genii趁機來襲。

1.11 "The Eye" 暴風眼
敵人控制住了Weir和Mckay等人，Sheppard少校和他們玩起了貓抓老鼠遊戲，儘力挽救這個不利的局面。

1.12 "The Defiant One" 挑戰
Sheppard小隊發現了一架廢棄的Wraith飛船，沒想到還有一個Wraith倖存者，還向他們發出挑戰。

1.13 "Hot Zone" 疫區
約三分一的Atlantis居民感染了一種病毒，導致他們產生幻覺甚至死亡。Atlantis實行封閉以爭取時間解決問題。

1.14 "Sanctuary" 避難所
小隊發現一個天堂般的星球，這裏可以免受Wraith的傷害。他們想把這裏當避難基地，但本地居民卻說他們的神不允許。

1.15 "Before I Sleep" 沉睡之前
一個處於假死狀態老嫗被發現，她竟然是Weir博士，不過是一萬年前的事了。她講述了一萬年前地球人探測Atlantis的故事。

1.16 "The Brotherhood" 兄弟會
探測小隊前往Dagan行星尋找珍貴的零點模塊，但當他們找到后當地居民卻改變了想法阻止他們帶走。

1.17 "Letters Form Pegasus" 飛馬星系的來信
Wraith即將來襲，Atlantis的遠征隊員們紛紛將自己的心情記錄下來，連同發現的資料通過超級壓縮后寄回了地球。

1.18 "The Gift" 禮物
Teyla開始頻繁做著惡夢，她想起她和父親都是Wraith的實驗品，和Wraith有著心靈感應。

1.19 "The Siege, Part 1" 包圍（上）
Wraith艦隊正在來Atlantis路上，遠征隊開始尋找躲避的星球，Makay帶一隊人試圖激活古人的防禦軌道衛星平台。

1.20 "The Siege, Part 2" 包圍（中）
一個新的軍事分遣隊來到Atlantis，他們將和遠征隊一起保衛Atlantis，而Wraith艦隊終於到來了。